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2003年，他迎来仕途转折，出任信阳市委常委、政法委书记。此后一直从事政法工作。历任河南省公安厅党委委员、政治部主任，公安部政治部人事训练局局长，公安部政治部副主任、人事训练局局长。
颜宁宣布加盟后，网上随即传出其回国的“真实原因”是人工智能会使结构生物学家“失业”。11月11日，颜宁在其个人微博发长文回应称，“AlphaFold在我们过去解析的诸多结构的基础上，去年的预测达到了我们2017年的水平；今年依旧停留在我们2017年的水平（这里仅针对Nav/Cav）。在与专门做结构预测的AI团队合作，他们做预测，我们做实验，测试新型小分子与蛋白的相互作用，迄今为止预测无一正确。”AlphaFold是预测蛋白质结构的人工智能平台。
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