在省级层面，福建疾控改革走在全国前列。2021年5月24日，福建省发布了《关于进一步深化医药卫生体制改革的意见》，明确了将依托同级卫健部门设置市、县级疾病预防控制局，福建也成为国家疾病预防控制局成立后，率先公布省、市、县疾控局组建总体框架的省份。2021年8月，福建省疾病预防控制局（筹）在福州揭牌，为全国首个挂牌的省疾控局。

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　　国家疾控局与各地疾控机构的关系，经方案明确，国家疾控局领导地方各级疾病预防控制机构业务工作，制定监督检查和考核评价办法并组织实施。审核省级疾病预防控制局的监测预警等规划计划和应急预案，指导开展监测预警、免疫规划和隔离防控等相关工作，建立上下联动的分工协作机制。/p>